Елена Ксенофонтова была замужем три раза, однако, личная жизнь актрисы никак не складывалась. Она так и не смогла обрести счастья с мужчиной. Однако, у актрисы были дети, которые стали смыслом её жизни. Сын Тимофей родился во втором браке актрисы, сейчас ему 18 лет, и он активно ищет своё призвание.
В третьем браке Ксенофонтова родила дочь Софию. Актрисе было 38 лет, когда она решилась вновь стать мамой. Правда, чтобы получить опеку над Софией, Елене прошлось пройти огонь, воду и медные трубы. Муж обвинял её во всех грехах, требуя у неё квартиру и дочь. Хотя на самом деле, это супруг относился к ней грубо, с пренебрежением. Суд встал на сторону актрисы.
Сейчас Елена ни о чём не беспокоится и наслаждается материнством. Её очаровательной дочери исполнилось 10 лет. София точная копия своей мамы, также она унаследовала, и рыжие волосы своей родительницы. Актриса не часто делиться снимками своих отпрысков, однако, по случаю дня рождения Софии, она опубликовала несколько фото.